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    外周血DNA和hTERT在肺癌诊断中的应用

    发表时间:2010-04-20  浏览次数:579次

      作者:王京,吕可洁,朱广昌 作者单位:北京,首都医科大学附属北京友谊医院胸外科

      【摘要】 目的 检测肺癌患者血清DNA含量及hTERT的表达水平,寻求微创、高敏感性及特异性的检测方法,为肺癌早期诊断提供新指标。 方法 41例病理证实肺癌患者,22例正常人设为对照组。磁珠悬浮法提取测定血清DNA含量;巢式PCR法扩增血清hTERT片段,测定灰度比。 结果 肺癌患者、正常人血清DNA含量均数分别为33.464和18.420,肺癌组血清DNA浓度显著高于正常对照组(P<0.01)。巢式PCR法扩增血清hTERT片段,测定灰度比作为诊断分界点,绘制ROC曲线,AZ=0.852,AZ的95%置信区间为CI(0.750,0.953,P=0.000),因此可以认为血清hTERT对于肺癌的诊断具有中等准确性。诊断分界点=0.4时,其Kappa=0.477,(P<0.01),有统计学意义,其与病理诊断的一致性较好。结论 外周血DNA和hTERT在肺癌诊断中具有较好的敏感性和特异性,可能成为肺癌早期诊断的新检测手段。

      【关键词】 肺癌;DNA;hTERT;基因诊断

      Application of Serum DNA and hTERT in Diagnose of Lung Cancer

      WANG Jing, LV Kejie,ZHU Guangchang

      Department of Throcic Surgery, Beijing Friendship Hospital Affiliated of the Capital University of Medicine Sciences,Beijing 100050,ChinaAbstract:Objective This study designed to assess a quantitative molecular assay of serum DNA and the expression of hTERT in patients with lung cancers to explore a novel noninvasive approach,elevating the sensitivity and specificity in diagnose of lung cancer. We conducted the clinical study to provide a new marker for earlier lung cancer detection. Methods Fortyone informed patients with lung cancers and 22 healthy persons were included as control. DNA was extracted from serum samples with MaGaZorb DNA MiniPrep Kit and quantificated , then hTERT sequences was amplified by nested PCR using gene primers. Results Mean concentration of serum DNA between patients with lung cancers and healthy persons was 33.464μg/ml and 18.420μg/ml respectively. Concentration of free circulation DNA in patients with lung cancers was higher than the other group (P<0.01). The area under the ROC curve by ratio of gray scale was 0.852 (95% CI, 0.750 to 0.953). Amplification of serum hTERT by nested PCR was a approach with moderate veracity to detect lung cancers. Meanwhile, it had a good coherence with pathology (Kappa=0.477,P<0.01). Conclusion The level of free circulating DNA in patients with lung cancers was higher than healthy persons. Amplification of serum hTERT by nested PCR was a approach with high sensitivity. So it may be a new, noninvasive approach for early detection of lung cancers.

      Key words:Lung cancer;DNA;hTERT;Gene diagnosis

      研究表明恶性肿瘤患者循环血中DNA水平不仅远远高于正常人,而且还具有肿瘤特征性的DNA改变,并和肿瘤组织中表达的同一基因一致[1]。端粒酶在永生化细胞系及恶性肿瘤衍生的细胞株中表达均为阳性,在正常细胞中不表达[2]。通过对肺癌患者外周血DNA的提取分析,巢式PCR法扩增血清hTERT(人类端粒酶逆转录酶),研究其表达水平,将为肺癌的早期诊断提供重要线索,并将可能为肺癌的治疗、术后监测及预后的判断提供重要依据。为此,我们检测了肺癌患者外周血DNA水平及hTERT浓度,以探讨外周血DNA及hTERT浓度检测对肺癌的诊断价值。

      1 资料与方法

      1.1 研究对象

      选择胸外科2005年经细胞学或病理学检查证实首次治疗的肺癌患者41例;其中腺癌19例,鳞癌15例,鳞腺癌2例,小细胞癌3例,大细胞癌2例;男性17例,女性24例;年龄18~75岁,平均年龄59岁;按世界卫生组织(WHO)肿瘤分期标准:Ⅰ期14例、Ⅱ期18例、Ⅲa期9例。并随机选择健康体检者22例进行对照。所有对象外周血白细胞、肝肾功能正常,无慢性肝炎和自身免疫系统疾病。

      1.2 方法

      1.2.1 实验试剂 (1)琼脂糖、TaqDNA聚合酶;(2)试剂盒:磁珠纯化DNA试剂盒(BSCOSS2),北京佰亿新创科技有限公司;TaqPCR试剂盒(KT10101),北京天为时代公司;DNA Marker1(MD10101),北京天为时代公司;PCR引物,北京赛百盛基因技术有限公司;(3)PCR引物设计与合成:hTERT碱基序列定位于5p15.33,外重引物343bp(2 647~2 989),内重引物326bp(2 662~2 989,GenBank assession number AF015950),应用Primer3分析软件进行设计,北京赛百盛基因技术有限公司。

      hTERTup(P1): 5′GCGTTTGGTGGATGATTTCT3′

      hTERTdown(P2): 5′CAAGACCCCAAAGAGTTTGC3′

      hTERTup(P3): 5′TTTCTTGTTGGTGACACCTC3′

      hTERTdown(P4): 5′CAAGACCCCAAAGAGTTTGC3′

      1.2.2 主要设备 DNA Thermal Cycler,美国Perkin Elmer Cetus公司;紫外凝胶成像仪Chemi Doc,意大利BioRAD;紫外可见分光光度计Ultrospec3100,英国Biochrom Ltd;台式低温离心机,上海安亭科学仪器厂;低温冰箱ULT13863V30,美国REVCO公司;电泳仪EPS300,上海天能科技有限公司。

      1.2.3 实验方法 (1)血清DNA的提取及浓度测定。抽取实验对象3ml血标本置入红管离心处理(如不能及时处理,可存放4℃冰箱不超过6小时)——取离心后上层血清置入1.5ml离心管,-80℃保存;血清标本、MagaZorb DNA MiniPrep Kit 试剂室温化,取12μl PK(蛋白酶)置入1.5ml微量离心管,取120μl血清移至上管,并移入120μl Lysis Buffer,混匀15秒,56℃温浴10min;加300μl Binding Buffer 至上管,加入12μl混匀的MagaZorb试剂,充分混匀,室温温浴10min,将微量离心管放于磁力架上,吸附已结合DNA的磁珠,弃上清液备用;加600μl Wash Buffer 至上述微量离心管充分混匀后放于磁力架上,吸附磁珠,弃上清液,重复洗涤1次;加20μl Elution Buffer 至上述微量离心管充分混匀10min后放于磁力架上,吸附磁珠,仔细将上清液移入干净微量离心管,-20℃保存备用;2.5μl DNA 产物溶于500μl 去离子水中,稀释200倍,取90μl去离子水入比色皿作为对照,放入紫外可见光分光光度计比色架进行标准化;擦净比色皿,移入90μl稀释后的DNA产物,测定浓度并记录数值。每个样本测定3次,取中间值,DNA浓度(μg/ml)=测定DNA浓度/6;(2)巢式PCR扩增hTERT。第一次扩增,PCR扩增体系(25μl):10×Reaction Buffer2.5μl;dNTP Mixture(2.5mmol/l each)2μl;Taq(2.5u/μl)0.35μl;GAPDHup(10μmol/l)1μl;GAPDHdown(10μmol/l)1μl;DNA产物2μl;ddH2O16.15μl

      反应体系加石蜡油20μl。

      反应条件:94℃预变性3min;94℃变性30s;52℃退火1min;72℃延伸1min;20个循环后72℃延伸10min

      第一次扩增产物稀释100倍,取4μl用于第二次扩增。

      第二次扩增,PCR扩增体系(25μl):10×Reaction Buffer 2.5μl;dNTP Mixture(2.5mmol/l each)2μl;Taq(2.5u/μl) 0.3μl;GAPDHup(10μmol/l)1μl;GAPDHdown(10μmol/l)1μl;第一次扩增产物(1%)4μl;ddH2O14.2μl

      反应体系加石蜡油20μl。反应条件:预变性、94℃、3min;变性、94℃、30s;退火、52℃、1min;延伸、72℃、1min;26个循环后72℃延伸10min

      反应结束,取7μl PCR产物在1.25%的琼脂糖凝胶(含0.5%溴化乙啶)电泳,紫外灯观察,紫外凝胶成像仪扫描成像。每次均设阳性及阴性对照。成像照片应用图像分析处理系统进行灰度扫描,分析测定面积的积分光密度值。

      1.3 统计学方法

      结果经SPSS11.5统计分析软件进行分析处理,计量资料采用均数±标准差描述,单因素方差分析;计数资料采用构成比描述,卡方检验。建立ROC曲线(受试者工作特征曲线),计算曲线下面积,两者一致性比较采用Kappa检验方法,P<0.01差异有统计学意义,0.010.05差异无统计学意义。

      2 结果

      2.1 DNA含量测定

      实验提取63例血清标本DNA(肺癌组41例,正常对照组22例),紫外可见分光光度计测定浓度:肺癌组均数为33.463 7μg/ml,标准差为9.45118,95%CI(30.48,36.45)μg/ml,双侧检验P=0.333>0.05,本组数据近似正态分布。正常对照组均数为18.4200μg/ml,标准差为5.56294,95%CI(14.44,22.40)μg/ml,双侧检验P=0.999,本组数据近似正态分布。

      两组数据经SPSS11.5统计分析软件进行单因素方差分析P<0.01,差异有统计学意义,由此可以认为肺癌组血清DNA含量显著高于正常对照组。

      2.2 血清hTERT表达检测

      首先通过管家基因GAPDH验证DNA质量,使用双重引物P1P2、P3P4 通过巢式PCR扩增hTERT,1.25%琼脂糖电泳后照相。实验中用提取肺癌组织DNA作阳性对照,ddH2O作阴性对照,对63例研究对象的血清DNA扩增后照片中条带进行灰度测定,并与相应管家基因GAPDH扩增得到的条带灰度值相比,得到hTERT灰度比值,见表1。表1 hTERT扩增后灰度比测定结果拆分为2×2表格,计算出FPR值(假阳性率)和TPR值(真阳性率—敏感度)构成一对,即为ROC工作点,见表2。表2 hTERT的ROC工作点 ROC曲线下面积AZ=0.852,AZ的95%置信区间为CI(0.750,0.953,P=0.000),因此可以认为血清hTERT对于肺癌的诊断具有中等准确性。进一步取不同的灰度比值作为分界点,对其诊断敏感性、特异性进行分析,并计算其Kappa值。当诊断分界点为0.2时Se=82.93%,Sp=68.18%,Kappa=0.456;当诊断分界点为0.4时Se=75.61%,Sp=86.36%,Kappa=0.477;当诊断分界点为0.6时Se=65.85%,Sp=95.45%,Kappa=0.416;当诊断分界点为0.8时Se=56.10%,Sp=100%, Kappa=0.367

      由上分析可见,诊断分界点=0.4时,其Kappa=0.477,敏感性Se=75.61%,特异性Sp=86.36%,阳性预测值PV+=31/33=93.94%,阴性预测值PV-=10/29=34.48%;敏感性、特异性较好,Kappa高于其他诊断分界点,当Kappa=0.477时P<0.01,差异有统计学意义,其与诊断金标准——病理诊断的一致性较好。所以利用巢式PCR扩增血清hTERT对肺癌有诊断价值。

      3 讨论

      在当今的医疗条件下,如何能够早期发现恶性肿瘤是提高其疗效的关键。理想的检测方法应该是取材无创或微创、方法简便能适应群体筛查、结果敏感特异性强。因此,外周血肿瘤相关指标的检测及研究成为热门。目前在肺癌检测中已广泛应用于临床的有CEA(癌胚抗原)、CYFRA211(细胞角蛋白片段)、NSE(神经原烯醇化酶)[3]。但是除NSE在小细胞肺癌的敏感度达到60%~80%外[4],其余敏感度均在50%以下[5]。本实验得出:肺癌患者血清DNA浓度显著高于正常人群;肺癌患者血清hTERT显著高于正常人群,诊断分界点=0.4时,其与诊断金标准——病理诊断的一致性较好。外周血DNA和hTERT在肺癌诊断中具有临床应用价值,为肺癌的早期诊断及筛查提供了新的手段,其检测技术成熟,方法简单,易于掌握;受检者痛苦小,费用低,易于接受,且可批量检测用于群体筛查;与病理诊断具有较好的一致性。因此,该项指标具有较好的应用前景,值得进一步研究推广。

      【参考文献】

      [1] Sozzi G,Conte D,Leon M,et al.Quantification of Free Circulation DNA as a Ddiagnostic Marker in Lung Cancer [J]. Journal of Clinical Oncology,2003,21(21):39023908.

      [2] Oh S,Song YH,Yim J,et al. Identification of Mad as a repressor of the human telomerase (hTERT) gene [J]. Oncogene,2000,19(11):14851490.

      [3] 陆慰萱. 呼吸系统疾病诊断与诊断分析[M]. 上海:上海科学技术出版社,2004.443449.

      [4] 张昕,张湘茹.肺癌肿瘤标志物的临床价值[J]. 癌症进展杂志,2005,3(3):156162.

      [5] Ando S,Kimura H,Iwai N,et al. Optimal combination of seven tumor markers in prediction of advanced stage at first examination of patients with nonsmall cell lung cancer [J]. Anticancer Research,2001,21(4):3085

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